Hot Cheetos gelten als eine schlechte Wahl für die Ernährung, da sie reich an Fett und Natrium sind und mehrere künstliche Zutaten enthalten. Hot Cheetos enthalten auch einen hohen Anteil an künstlichen Gewürzen und Mononatriumglutamat, häufig als MSG bezeichnet. Das Gewürz in Hot Cheetos und anderen beliebten Snacks ist eine häufige Ursache für Magen-Darm-Beschwerden, insbesondere bei Kindern, die diese Snacks im Übermaß konsumieren.
Mehrere Schulbezirke in den Vereinigten Staaten haben Hot Cheetos als zugelassenen Snack verboten, da sie einen minimalen Nährwert bieten. Magen-Darm-Symptome, die durch Hot Cheetos verursacht werden, sind Erbrechen, Säurereflux, Blähungen, Brennen und Schluckauf. Die Symptome können mit Antazida gelindert werden und scharfe Snacks aus der Ernährung gestrichen werden.
Forschungsstudien zeigen auch, dass die Inhaltsstoffe in Hot Cheetos und anderen scharfen Snacks eine Sucht-ähnliche Gehirnreaktion auslösen können. Hot Cheetos haben eine leuchtend rote Farbe, und es gab mehrere Berichte von Eltern, dass die scharfen Snacks bei ihren Kindern roten Stuhlgang verursacht haben, was wiederum die Angst erzeugt, dass ihre Kinder innerlich bluten. Übermäßiger Konsum von Hot Cheetos kann aufgrund des hohen Natriumgehalts auch zu Bluthochdruck und Dehydration führen.