Der Hauptunterschied zwischen Pfirsichen und Nektarinen ist die Haut. Pfirsichhaut ist unscharf, während Nektarinenhaut glatt und eher rot ist. Beim Kochen und Backen gibt es keinen Unterschied zwischen den beiden unter der Haut und sie können in Rezepten austauschbar verwendet werden.
Roh gegessen sind Nektarinen süßer und fester, würziger und riechen stärker als Pfirsiche. Ernährungsphysiologisch enthalten Nektarinen doppelt so viel Vitamin A, viel mehr Kalium und etwas mehr Vitamin C als Pfirsiche. Nektarinen sind etwas kleiner als Pfirsiche und anfälliger für Krankheiten wie Braunfäule und Bakterienflecken.
Es gibt eine Vielzahl von Sorten sowohl von Nektarinen als auch von Pfirsichen mit unterschiedlichen Eigenschaften der Frucht. Einige glauben, dass Nektarinen eine Form des Pfirsichs sind, während andere denken, dass die Nektarine eine natürlich vorkommende Mutation des Pfirsichs ist. Darwin beschrieb sowohl Pfirsichbäume, die Nektarinen züchten, als auch Nektarinenbäume, die Pfirsiche züchten. Es wird angenommen, dass sowohl Nektarinen als auch Pfirsiche vor 2.000 Jahren aus China stammen. Sie wurden beide im alten Persien, Griechenland und Rom angebaut. Der Pfirsich wurde um 300 v. Chr. benannt, während das Wort "Nektarine" erstmals 1629 in englischer Sprache auftauchte.