Eine Reihe von Tieren fressen Tomaten, darunter Eichhörnchen, Kaninchen, Rehe und Waschbären. Manche Tiere, wie Waldmurmeltiere, zerstören Tomatenpflanzen, während sie die Früchte aufnehmen.
Es kann schwierig sein, Tiere von Tomatenpflanzen fernzuhalten, und die Methoden variieren je nach Tier. Es kann schwierig sein, Rehe mit einem Zaun fernzuhalten, da sie über einen Zaun springen können, der kürzer als etwa 9 Fuß ist. Ein bellender Hund ist oft die beste Abschreckung für Rehe und Katzen können wirksame Beschützer gegen Eichhörnchen und andere Kleintiere sein.
Bei einigen grabenden Tieren wie Waldmurmeltieren muss ein Zaun mehrere Meter tief eingegraben werden, damit sie nicht darunter graben. Für hochintelligente und anpassungsfähige Waschbären kann nur ein voller Käfig sie von Tomatenpflanzen fernhalten. Gefälschte Eulen oder Schlangen können helfen, Kaninchen in Schach zu halten.
Das Verteilen natürlicher Substanzen wie Urin von Raubtieren oder Peperoni kann ungiftig und effektiv sein, um Tiere von Tomatenpflanzen fernzuhalten. Einige Gärtner pflanzen mehr Tomaten, als sie brauchen, da sie wissen, dass Tiere einige davon auffressen werden. In einigen Gebieten ist es für Hausbesitzer illegal, wilde Tiere zu fangen. Auch wenn das Tier nicht verletzt wird, kann es zu Verletzungen oder zum Tod des Tieres führen, wenn es aus seinem üblichen Bereich verlegt wird.