Pekannüsse sind zwei Monate bis zwei Jahre haltbar. Wie lange sie haltbar sind, hängt von der Lagermethode und der Temperatur ab. Das Schälen der Pekannüsse führt zu einer kürzeren Haltbarkeit.
Bewahren Sie Pekannüsse in sauberen, dicht verschlossenen Trockenbeuteln oder Gläsern auf; Nüsse nehmen leicht starke Gerüche auf. Kleine Stücke verderben schneller, also kaufen Sie Pekannusshälften oder ganze, ungeknackte Nüsse. Verpackte Pekannüsse haben oft ein Haltbarkeitsdatum.
Pekannüsse in der Schale halten bis zu zwei Jahre, wenn sie in luftdichten Behältern eingefroren werden. Gefrorene geschälte Pekannüsse sollten innerhalb von 18 Monaten verbraucht werden. Die Kühlung hält Pekannüsse etwa zwei Monate lang. Die Lagerung von Nüssen bei Raumtemperatur ist die am wenigsten wirksame Methode und wird nicht empfohlen.