Koffein ist ein polares Molekül. Diese Eigenschaft von Koffein macht es möglich, Koffeinmoleküle leicht aus Kaffeebohnen, Kakao und Teeblättern zu entfernen, wodurch sie zu 97 Prozent koffeinfrei sind. Nach dem Prinzip "Gleiches löst Gleiches" werden polare Lösungsmittel verwendet, um Koffein aus diesen Lebensmitteln zu extrahieren.
Je nach Verfahren können zur Entkoffeinierung von Kaffeebohnen Ethylacetat oder Methylenchlorid als polare Lösungsmittel verwendet werden. Die gedämpften Kaffeebohnen werden in den polaren Lösungsmitteln gespült und die Koffeinmoleküle binden an die Moleküle des Lösungsmittels. Anschließend werden die Kaffeebohnen erneut gedämpft, um restliche Lösungsmittel zu entfernen, wodurch entkoffeinierter Kaffee entsteht. Das extrahierte Koffein wird weiterverarbeitet und in der Lebensmittel- und Pharmaindustrie verwendet.