Die meisten Apfelmus-Produkte enthalten keine Konservierungsstoffe, daher werden sie irgendwann schlecht und sollten weggeworfen werden. Die meisten Apfelmus-Behälter, egal ob als Einzelportion oder im Glas, haben eine Haltbarkeit Datum, das vor dem Essen notiert werden sollte.
Ungeöffnete Behälter mit Apfelmus können bis zu einem Jahr gut gegessen werden, solange die Behälter an einem kühlen, trockenen Ort aufbewahrt werden, z. B. in einer Speisekammer bei Raumtemperatur. Sobald ein Behälter mit Apfelmus geöffnet ist, muss er im Kühlschrank aufbewahrt werden. Nach dem Öffnen ist Apfelmus noch bis zu 10 Tage haltbar. Wie bei allem, sollte das Apfelmus, wenn nicht bekannt ist, wie lange es im Kühlschrank aufbewahrt wurde, oder wenn es einen unangenehmen Geruch oder Geschmack hat, es sofort entsorgt werden.