Zu den Krankheiten, die die frühen amerikanischen Kolonisten heimsuchten, gehörten Typhus, auch bekannt als Typhus oder Fleckfieber, sowie Malaria und Enzephalitis. Ruhr und Hypernatriämie, auch bekannt als Salzvergiftung, stellten eine bemerkenswerte Bedrohung für die Gesundheit der Kolonialamerikaner.
Kleinpocken waren zu dieser Zeit auch eine unheilvolle Bedrohung. Eine Pockenepidemie im kolonialen Williamsburg von 1747 bis 1758 betraf 754 Menschen. Große Populationen der amerikanischen Ureinwohner wurden während der Kolonialzeit ausgelöscht, als sie Krankheiten wie Pocken bekamen. Epidemien von durch Europa eingeführten Krankheiten verringerten die Bevölkerung der amerikanischen Ureinwohner in Neuengland zwischen 1615 und 1633 um 90 Prozent.
