Theorien darüber, was mit der Kolonie Roanoke passiert ist, reichen von Kolonisten, die an einer Krankheit starben, bis hin zu der Tötung durch lokale Indianerstämme. Eine andere vorherrschende Theorie besagt, dass die Kolonisten Roanoke verlassen haben.
Über die Kolonie Roanoke ist bekannt, dass die Kolonie aus 17 Frauen, 11 Kindern und 90 Männern bestand. Die Anwesenheit von Frauen und Kindern deutet darauf hin, dass die Absicht dieser Gruppe, in die Neue Welt zu gehen, darin bestand, sich dort niederzulassen und ein neues Leben zu beginnen, weg von England.
Als die Roanoke-Kolonie gefunden wurde, gab es keine Spuren der Kolonisten, die sich dort niederließen. Dies führt zu der ersten Theorie über Roanoke.
Die vorherrschende Theorie ist, dass die Kolonisten sie verlassen haben müssen, da in der Nähe der Roanoke-Kolonie keine Kolonisten gefunden wurden. Was die Kolonisten angeht, nachdem sie die Kolonie verlassen hatten, glauben Forscher, dass die Kolonisten durch ganz North Carolina reisten, hauptsächlich den Albemarle Sound und den Chowan River nutzten und sich einem der vielen Stämme anschlossen, denen sie auf dem Weg begegneten.
Andere Theorien besagen, dass die Kolonisten an Krankheiten erkrankten, die durch Mikroben der Neuen Welt verursacht wurden, denen ihre Körper noch nie zuvor ausgesetzt waren, oder dass die amerikanischen Ureinwohner die Kolonisten getötet haben. Auf jeden Fall sind sich die Forscher einig, dass sich die Kolonisten getrennt haben und dies schließlich zu ihrem Verschwinden führte.