Die Temperatur beeinflusst den Prozentsatz der keimenden Samen und die Keimungsrate. Samen, die bei höheren Temperaturen aufbewahrt werden, neigen eher dazu, sich zu verderben und nicht zu keimen. Sobald die Samen zu keimen beginnen, stimulieren höhere Temperaturen eine schnellere Keimung bis zu einer optimalen Temperatur, wonach die Keimungsgeschwindigkeit abnimmt.
Die optimale Temperatur für die Keimungsgeschwindigkeit variiert je nach Art. Trockene Samen keimen eher bei höheren Temperaturen, aber nasse Samen keimen bei höheren Temperaturen weniger wahrscheinlich. Der Wechsel zwischen kalten und heißen Temperaturen regt wahrscheinlich viele nasse Samen zum Keimen an. Einige Samenarten werden durch sehr kalte Temperaturen zum Keimen angeregt.