Laut Vetstreet leben Chihuahuas 12 bis 20 Jahre. Gesunde Chihuahuas haben eine der längsten Lebenserwartungen aller Hunderassen. Sie sind auch die kleinste Rasse und die einzige Rasse in natürlicher Spielzeuggröße.
Obwohl der Chihuahua ein langes Leben genießen kann, gibt es viele gesundheitliche Probleme, die diese Hunde plagen. Wie viele kleine Hunde können Chihuahuas einen Luftröhrenkollaps entwickeln, der eine schwere Obstruktion der Atemwege verursacht. Viele Chihuahuas haben eine Molera, eine offene weiche Stelle am Schädel, die sich nie vollständig schließt, was zu Kopfverletzungen, Krampfanfällen und zum Tod führen kann. Einige Chihuahuas haben einen portosystemischen Shunt, einen Geburtsfehler, der dazu führt, dass das Blut von der Leber weggeleitet wird und zu einer tödlichen Ansammlung von Giftstoffen führt.