Je nach Art kann es zwischen mehreren Wochen und mehreren Monaten dauern, bis ein Eidechsenei schlüpft. Bei Haustiereidechsen wie Anoles sollten die Eier etwa nach 4 bis 6 Wochen schlüpfen, während die Eier von größeren, wilden Eidechsen wie Komodowaranen 7 bis 8 Monate brauchen können, um zu schlüpfen.
Die Umgebung ist manchmal auch ein entscheidender Faktor dafür, wann die Eier einer Eidechse schlüpfen. Beispielsweise haben Eidechsen, die als zarte Skinke bekannt sind, einen Überlebensmechanismus entwickelt, der dazu führt, dass ihre Jungen vorzeitig aus ihren Eiern schlüpfen. Normalerweise müssen die Eier von Skinken 4 bis 8 Wochen lang bebrüten, bevor sie schlüpfen können. Wenn die jungen Eidechsen jedoch im Inneren der Eier beginnen, Vibrationen zu spüren, die auf die Annäherung eines Raubtiers hindeuten, schlüpfen sie vorzeitig, um dem Raubtier zu entkommen. Auch wenn dies nicht für alle Echsen typisch ist, unterstreicht dieses Beispiel, dass Eier nicht unnötig bewegt werden sollten, wenn man versucht, Eidechsen in Gefangenschaft zu züchten.
Während der ersten 3 bis 4 Tage "festigt" ein Eidechsenei, was bedeutet, dass sich der Inhalt der Eier am Boden des Eies absetzt. Ist dies der Fall, sollte das Ei nicht unnötig gedreht oder bewegt werden, da dies dem Embryo schaden kann. Wenn die Eier in Bündeln gelegt werden, können sie außerdem dazu neigen, zusammenzukleben. In diesem Fall sollten die Eier nicht auseinandergedrückt werden – dies könnte die Schale knacken oder aufbrechen.