Affen verteidigen sich auf unterschiedliche Weise, die von Art zu Art unterschiedlich ist. Die meisten verlassen sich auf eine Kombination aus dem Leben in sozialen Gruppen, der Flucht vor Bedrohungen durch Klettern in den Bäumen und dem Aussenden von Lauten, die andere in der Gruppe vor drohender Gefahr warnen. Einige Arten führen bei Bedrohung körperliche Kämpfe, während andere eher vor Raubtieren und anderen Bedrohungen fliehen.
Die Männchen vieler Affenarten sind viel größer als die Weibchen. Diese größeren Männchen, die den in der Truppe lebenden Weibchen oft weit unterlegen sind, sind für den Kampf gegen Raubtiere besser gerüstet als die kleineren Weibchen. Tatsächlich ist der Schutz der Truppe eine ihrer wichtigsten Aufgaben. Viele Affen, darunter die winzigen Zwergseidenäffchen, kämpfen hartnäckig, um sich und die Mitglieder ihrer Truppen zu schützen.
Einige Arten, wie zum Beispiel Paviane, können bedrohliche Tiere vertreiben, indem sie ihre langen Eckzähne ausschneiden. Wenn die Einschüchterung jedoch nicht funktioniert, kämpfen die Paviane auch, um sich zu verteidigen.
Paviane und andere Affen sind hauptsächlich tagaktiv, was dazu führt, dass sie nachts für Raubtiere anfällig sind. Um sich beim Schlafen zu schützen, schlafen Affen oft in Bäumen oder auf Klippen. Dies schränkt die Möglichkeiten ein, wie sich ein Raubtier ihnen nähern kann, und erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass es das Raubtier rechtzeitig bemerkt, um zu kämpfen oder zu fliehen.