Die Todesursache von John Hancock ist nicht bekannt. Es ist jedoch bekannt, dass er Gicht hatte und sich seine Gesundheit einige Jahre vor seinem Tod verschlechtert hatte. Er starb 1793 in seinem Haus im Alter von 56 Jahren, als er noch Gouverneur von Massachusetts war.
Obwohl John Hancock eine entscheidende Rolle bei der Organisation der Kolonien und der Gründung der Vereinigten Staaten spielte, ist er vor allem für seine Unterschrift bekannt. Bei der Durchsicht einer Kopie der Unabhängigkeitserklärung ist die Unterschrift von John Hancock schwer zu übersehen. Es ist leicht das lesbarste und erkennbarste auf dem Dokument. Zum Zeitpunkt der Unterzeichnung war Hancock Präsident des Kontinentalkongresses. Als solcher war er der Erste, der das Dokument unterschrieb. Die Legende besagt, dass Hancock seinen Namen so kühn unterschrieb, weil er sicherstellen wollte, dass der König von England seinen Namen ohne Brille lesen konnte. Bis heute ist die Aufforderung, "Ihren John Hancock auf ein Dokument zu setzen", eine Möglichkeit, jemanden zu bitten, es zu unterschreiben. Obwohl Hancock Präsidentschaftsbestrebungen hatte, als es an der Zeit war, Beamte zu wählen, um die neu gegründeten Vereinigten Staaten zu regieren, wurde er bei den ersten Präsidentschaftswahlen von einem George Washington besiegt.