Quecksilber hat einen großen metallischen Kern mit einer relativ dünnen felsigen Kruste und einem Mantel, der eine große Menge an Schwefel und Kalium enthält. Sein Magnetfeld ist außermittig, was darauf hindeutet, dass seine innere Struktur komplex ist und ungewöhnlich. Nach der Erde ist er der zweitdichteste Planet im Sonnensystem.
Quecksilber hat keine Atmosphäre, aber es wird von Gasen in seiner sogenannten Exosphäre umgeben. Dies wird durch Sonnenwind erzeugt, der Atome von der Merkuroberfläche abstreift und in den Weltraum schickt, wo sie mit winzigen Meteoroiden kollidieren. Dadurch hat Merkur einen Schweif ähnlich einem Kometen.