Das Paläozoikum, das innerhalb weniger Millionen Jahre das Erscheinen fast aller Tierstämme markierte, wurde durch ein Massenaussterben beendet. Das Massenaussterben war das genaue Gegenteil dessen, was die Ära begann, mit Über 90 Prozent des Lebens der Welt werden ausgelöscht. Die Erholung von diesem Massenaussterben dauerte fast 30 Millionen Jahre.
Es gibt viele Unterabschnitte im Paläozoikum, die die Jahrmillionen in kleinere Abschnitte aufteilen. Das Ende des Paläozoikums wird Perm genannt. In dieser Ära gab es zahlreiche Klimaänderungen sowie Schwankungen des Kohlendioxid- und Sauerstoffgehalts. Es gibt zahlreiche Hypothesen darüber, was das Aussterben am Ende des Perms verursacht hat, darunter das Meer, das Hydrogensulfat entlüftet, ein riesiger Meteor in der Antarktis oder sogar alle Möglichkeiten in einem.
