Kühe haben 60 Chromosomen: ein einzelnes Paar der Geschlechtschromosomen und 29 Paare Autosomen. Ähnlich wie bei anderen Säugetieren haben die Weibchen alle zwei der X-Chromosomen und die Männchen ein einzelnes Y- und X-Chromosom.
Laut dem Department of Animal and Poultry Science der University of Saskatchewan durchlaufen die Chromosomen der Kuh während der Phasen der Gametogenese einen Meioseprozess. Dies führt zu einer Hauptreproduktionszelle, die drei Polkörper und eine Eizelle produziert. Die Kuh steuert nur eines der X-Chromosomen im Prozess der Meiose bei. Alle Chromosomen sind tropfenförmig und haben das Zentromer am Ende, mit Ausnahme der Geschlechtschromosomen, die das Zentromer mehr in der Mitte des Chromosoms aufweisen.