Es ist nicht viel darüber bekannt, wie sich Plattwürmer schützen. Obwohl Plattwürmer ein schlechtes Sehvermögen haben, sind sie in der Lage, Dunkelheit und Licht und vielleicht Richtung zu erkennen und diese Sinne zu verwenden, um dunkle Stellen unter Felsen zu suchen, um sich zu verstecken. Darüber hinaus haben viele eine Färbung, die ihnen hilft, sich in ihre Umgebung einzufügen, und einige sind nur nachts aktiv. Einige marine Plattwürmer verwenden Farbe, Toxine und Tarnung als Verteidigung gegen Raubtiere.
Plattwürmer sind aufgrund ihres weichen, zarten Körpers gute Beuteziele. Die beste Verteidigung von Plattwürmern kann die Tarnung sein, die ihnen hilft, sich entweder in Sichtweite zu verstecken oder sich vollständig als andere Tiere zu tarnen. Einige Plattwürmer können ihre Textur und Farbe an die Nahrung anpassen, die sie bevorzugen.
Einige marine Plattwürmer scheinen die offensichtlichste Verteidigung zu haben, da ihre Färbung eine Anpassung ist, die sie unsichtbar macht. Wie viele wirbellose Tiere haben marine Plattwürmer die Verwendung von Farbmimikry entwickelt. Vielleicht ist dies so, dass ihre Färbung Fische imitiert, von denen die meisten ein gutes Sehvermögen haben. Andere marine Plattwürmer trotzen dem Prinzip der Tarnung, indem sie leuchtende Farben und Muster zeigen. Diese Anpassung kann auch als Schutz dienen, da sie Raubtiere warnt, dass ihre beabsichtigte Beute giftig sein könnte. Viele Plattwürmer im Meer scheiden Giftstoffe aus, die ein Raubtier dazu bringen können, loszulassen, bevor der Plattwurm getötet wird.