Da Amöben selbst mikroskopisch klein sind, können sie nur andere mikroskopisch kleine Nahrungspartikel wie Algen, Bakterien, verrottende Pflanzen- oder Tierstoffe und andere einzellige Organismen aufnehmen. Große Nahrungspartikel wären für Amöben unmöglich verdauen. Amöben ernähren sich, indem Sie sich an dem geeigneten Gegenstand festklammern und dann das Futter im Körper der Amöbe umschließen und verschlingen.
Um die Nahrungspartikel zu greifen, verwendet die Amöbe ein Körperteil, das als Pseudopode bekannt ist und das sie aus dem Hauptteil ihres Körpers herausstrecken kann. Der Pseudopode ist wahrscheinlich der wichtigste Teil der Amöbenzelle, da sich der Organismus auch durch Ausstrecken dieses Körperteils bewegt, um sich selbst mitzuziehen. Der andere Hauptteil der Zelle ist das Zytoplasma, eine geleeartige flüssige Substanz, die die Zelle ausfüllt.
Wenn die Amöbe die Nahrung in ihren Körper zieht, umgibt das Zytoplasma innerhalb der Zelle das Nahrungspartikel und speichert es mit einem Tropfen Wasser in der Nahrungsvakuole. Das Zytoplasma sondert Verdauungsenzyme in die Nahrungsvakuole ab, die die weicheren Teile der Beute abbauen. Sobald dies geschieht, werden die löslichen Nährstoffe in das Zytoplasma aufgenommen. Wenn sich die Amöbe vorwärts bewegt, gibt das Zytoplasma alle Teile frei, die nicht aufgelöst wurden.