Fledermäuse in freier Wildbahn leben durchschnittlich 10 bis 20 Jahre. Dies hängt davon ab, ob sie bis zum Erwachsenenalter überleben; Junge Fledermäuse haben eine hohe Sterblichkeitsrate. Nach den ersten drei Lebenswochen lernen sie das Fliegen, was ihre Überlebenschancen verbessert.
Es wurde festgestellt, dass eine einzelne Fledermaus einer kleinen braunen Fledermausart, Myotis lucifugus, fast 40 Jahre alt wird, was ein erheblicher Ausreißer von der durchschnittlichen Lebensdauer der Fledermaus ist. Biologen sind sich im Allgemeinen einig, dass Fledermäuse andere Säugetiere vergleichbarer Größe wie Nagetiere und Primaten überleben. Fledermäuse sind anfällig für einige Raubtiere und für Pilzparasiten wie Pseudogymnoascus destructans, von dem angenommen wird, dass es eine Krankheit namens White-Nose-Syndrom verursacht.
