Einzellige Organismen ernähren sich durch einen Prozess namens Phagozytose. Dieser Prozess ermöglicht es dem einzelligen Organismus, Nahrung zur Verdauung in den inneren Teil der Zelle zu bringen.
Eine Kombination von Chemikalien auf der Oberfläche des einzelligen Organismus sowie auf der gewünschten Nahrung ermöglicht es dem Organismus, Nahrung zu erkennen und sich an die Substanz anzuheften, die er zu fressen versucht. Nach der Anheftung wickelt der Organismus seine äußere Schicht, die äußere Zellmembran genannt, vollständig um das Nahrungspartikel. Sobald die Nahrung von der äußeren Zellmembran verschlungen wurde, schnürt sich die Membran zum Inneren der Zelle ab, wodurch ein Sack im Inneren der Zelle entsteht, der die Nahrung enthält, die als Vakuole bezeichnet wird. Die Vakuole und die Nahrung zusammen werden als Phagosom bezeichnet.
Das Phagosom kommt dann mit einem Lysosom in Kontakt. Ein Lysosom ist eine Vakuole, die Enzyme enthält. Das Lysosom injiziert diese Enzyme dann in das Phagosom, und sobald sie sich im Inneren befinden, zerlegen die Enzyme die Nahrung in einzelne Moleküle. Wenn von der Nahrung nur noch einzelne Organismen übrig sind, gilt sie als verdaut oder gegessen. Diese Moleküle können dann verwendet werden, um alles zu versorgen und aufzubauen, was der einzellige Organismus braucht.