Die Archaeen oder Archaebakterien sind die mit den Eukaryoten am engsten verwandte prokaryontische Gruppe. Dies liegt an der Ähnlichkeit von Genen und Stoffwechselprozessen, die sowohl Archaeen als auch Eukaryoten besitzen. Eine große Ähnlichkeit sind die Enzyme, die an der Transkription und Translation beteiligt sind.
Archaea oder Archaebakterien sind einzellige Mikroorganismen, die sich von Eubakterien unterscheiden und sich, obwohl sie einige ähnliche Eigenschaften aufweisen, auch von Eukaryoten unterscheiden. Sie ähneln Eubakterien darin, dass ihnen ein Zellkern fehlt. Sie sind bekannt für ihre Fähigkeit, unter extremen Umweltbedingungen wie hoher Hitze und salzhaltiger Umgebung zu existieren. Beispiele für diese Organismen sind Halophile, Methanogene und Thermophile.
