Prokaryontische Zellen und eukaryontische Zellen haben mehrere gemeinsame Merkmale, darunter die Verwendung von DNA zum Kodieren von Proteinen, RNA zur Translation in Proteine und Ribosomen zum Lesen der RNA. Beide Typen teilen auch eine solche Basiszelle Eigenschaften wie Zellmembranen und Moleküle wie Proteine, Lipide und Kohlenhydrate. Viele Prokaryoten und Eukaryoten haben auch Zellwände, aber die Bestandteile der Wände unterscheiden sich zwischen ihnen.
Weder Prokaryoten noch Eukaryoten verletzen eine der grundlegenden Eigenschaften des Lebens, wie es die Menschheit kennt, und so haben sie in Wahrheit viel mehr Gemeinsamkeiten als Unterschiede. Jeder muss Energiequellen verstoffwechseln und ATP erzeugen. Jeder verwendet chemische Sensoren, um auf seine Umgebung zu reagieren. Jeder ist von einem relativ engen Bereich von Umweltbedingungen abhängig, um die Homöostase aufrechtzuerhalten und zu gedeihen. Beide sind Teil von Ökosystemen, in denen sie sich entweder als Erzeuger oder als Verbraucher verhalten.
So viel die beiden Zelltypen gemeinsam haben, es gibt jedoch einige Aspekte, die für jeden einzigartig sind. Eukaryoten haben als definitives Merkmal membrangebundene Organellen, die Prokaryoten fehlen. Viele Prokaryonten-Produzenten verwenden die Photosynthese wie die Eukaryonten-Produzenten, aber einige sind chemoautotroph. Diese verwenden anorganische Verbindungen aus thermischen Öffnungen am Meeresboden und an anderen Orten, um Energie anstelle von Sonnenlicht zu erzeugen.
