Fische haben ein Verdauungssystem, das am Mund beginnt und am Anus endet. Es besteht normalerweise aus Mund, Speiseröhre, Magen, Bauchspeicheldrüse und Darm. Nicht alle Fischarten haben jedoch einen Magen, wie Cyprinidonts und Cypriniden, und pflanzenfressende Fische haben einen längeren Verdauungstrakt als fleischfressende Fische.
Nahrung wird durch den Mund in den Körper und dann in den Rachenraum aufgenommen, wo sie mit den Rachenzähnen zermahlen wird, bevor sie in die Speiseröhre gelangt. Die mit Muskeln geschichteten Wände der Speiseröhre können sich ausdehnen, um große Gegenstände aufzunehmen. Die Nahrung wird dann im Magen durch Stoffe, die von den Magendrüsen freigesetzt werden, zerlegt. Einige Fischarten haben am Anfang des Magens einen Muskelmagen, der den Verdauungsprozess einleitet. Pyloruscaeca befindet sich bei vielen Fischarten am Ende des Magens und setzt den Verdauungsprozess fort und erweitert den Darm. Die Verdauung wird durch die Sekretion von Enzymen aus der Bauchspeicheldrüse in den Darm unterstützt, wo der größte Teil der Nahrungsaufnahme stattfindet. Der Kot verlässt dann den Körper über den Anus.