Es gibt drei Hauptgruppen von Archaeabakterien: Crenarchaeota, Euryarchaeota und Korarchaeota. Crenarchaeota sind extrem hitzetolerant und Euryarchaeota überleben in sauerstofffreien oder salzigen Lebensräumen. Korarchaeota sind die am wenigsten verstandenen Gruppen.
Die meisten Archaebakterien sind Extremophile, die in Lebensräumen gedeihen, die für die meisten anderen Lebewesen unwirtlich sind. Crearchaeota sind Thermophile, von denen viele auch Schwefel und einen hohen Säuregehalt vertragen. Diese Organismen leben in vulkanischen Lebensräumen und heißen Quellen. Der pH-Wert ihrer Umgebung liegt zwischen 5 und 1, und sie halten Temperaturen über 230 Grad Fahrenheit stand.
Euryarchaeota enthält Halophile, Organismen, die in Umgebungen wie Salzseen gedeihen. Zu dieser Gruppe gehören auch Methanogene, die unter anaeroben Bedingungen leben, wie zum Beispiel in Feuchtgebieten und sogar im Darm anderer Tiere. Methangas ist das Produkt des Methanogenstoffwechsels.
Wie Crenarchaeota leben Korarchaeota in Hochtemperaturhabitaten wie heißen Quellen. Diese Organismen sind primitiv und gehören zu den am seltensten vorkommenden Archaebakterien in der Natur.
Archaebakterien und Eubakterien oder echte Bakterien haben einen gemeinsamen Vorfahren, und Archaebakterien ähneln echten Bakterien sowie dem eukaryotischen Leben. Die Forschung legt nahe, dass Eurkaryoten evolutionär aus Archaebakterien hervorgehen. Darüber hinaus wird vermutet, dass Eukaryoten und Crenarchaeota mehr gemeinsam haben als die verschiedenen Gruppen von Archaeabakterien miteinander.
