Ein aquatisches Ökosystem ist eine Gemeinschaft von Organismen und deren Interaktionen in einer Wasserumgebung. Diese Art von Ökosystem muss nicht groß sein. Ein Wassertropfen enthält ein ganzes aquatisches Ökosystem, da die Mikroorganismen in diesem Wassertropfen unabhängig von äußeren Organismen sind und von dieser kleinen Wassermenge vollständig unterstützt werden.
Ein aquatisches Ökosystem enthält eine Vielzahl von Lebewesen, von Fischen und Reptilien bis hin zu mikroskopisch kleinen Organismen wie Bakterien und Pilzen. Es gibt verschiedene Arten von aquatischen Ökosystemen, darunter Meeresökosysteme und Süßwasserökosysteme.
Ein marines Ökosystem ist ein Salzwasser-Ökosystem und das größte aquatische Ökosystem der Welt. Ein marines Ökosystem wiederum ist in kleinere Ökosysteme oder Zonen unterteilt. Ein Korallenriff ist beispielsweise ein eigenes Ökosystem, ebenso wie Lagunen und Gezeitenzonen. Diese Ökosysteme enthalten Algen, Korallen, Fische und Haie.
Ein weiterer wichtiger Typ von aquatischen Ökosystemen ist ein Süßwasserökosystem, das aus lentischen oder langsam fließenden Wasserökosystemen, lotischen oder schnell fließenden Wasserökosystemen und Feuchtgebietsökosystemen besteht. Lentische Ökosysteme umfassen Teiche und Seen, die in kleinere Zonen oder Ökosysteme wie Küstenzonen, Freiwasserzonen und Tiefseezonen zerfallen. Lotische Ökosysteme umfassen Flüsse und Bäche. Während Lentic- und Lotic-Ökosysteme reich an Fischen sind, enthalten Feuchtgebiet-Ökosysteme hauptsächlich Gefäßpflanzen und eine Vielzahl von Tierarten.