Killerwale sind aufgrund einer Reihe von Bedrohungen gefährdet, darunter Ölverschmutzungen, Bioakkumulation von PCB und anderen Schadstoffen, Lärmbelästigung, Kollisionen mit Schiffen, Verwicklung in Fanggeräte, Erschießungen durch Fischer und Lebensraumbeeinträchtigungen durch Walbeobachter. Darüber hinaus wirkt sich die Erschöpfung von Beutepopulationen wie Meeressäugern und bestimmten Fischarten auf das Ökosystem aus.
Zu den früheren Bedrohungen für Schwertwale gehörten der Fang für Aquarienausstellungen und die kommerzielle Jagd. Obwohl seit 2014 nur noch wenige Schwertwale wegen ihres kommerziellen Wertes gejagt werden, werden sie weiterhin von kommerziellen Fischern erlegt, die sie als Konkurrenten betrachten. Seit der Ölpest von Exxon Valdez im Jahr 1989 gelten Ölunfälle und andere Schadstoffaustritte als ernsthafte Bedrohung für Schwertwale. Zu den Lärmstörungen, die Killerwale betreffen, gehören das hochintensive Sonar der Marine, bei dem CAT-Scans nachgewiesen haben, dass es Blutungen um ihre Gehirne und Ohren verursacht, sowie Geräusche von Bohrungen, Schifffahrt und Lachsfarmen.
Im Jahr 2013 führte die Rote Liste gefährdeter Arten der Internationalen Union für die Erhaltung der Natur und der natürlichen Ressourcen die taxonomische Einheit der Schwertwale als mangelhaft an. Zuvor galten Schwertwale als eine Art, aber Forscher gehen davon aus, dass es mehrere Arten von Schwertwalen geben könnte, von denen einige ab 2014 gefährdet sind kleinere Gruppen und Reichweite in größeren Gebieten. Im Süden lebende Killerwale zum Beispiel, eine Gruppe von drei großen Schoten, die die Küstengewässer der westlichen Vereinigten Staaten und Kanadas bewohnen, wurden 2005 gemäß dem Endangered Species Act zu einer vom Aussterben bedrohten Art erklärt, und die National Oceanic and Atmospheric Administration erklärte ihr Verbreitungsgebiet ein kritischer Lebensraum, der 2006 unter Naturschutz steht.
