Schweizer Käse hat Löcher, weil die Kohlendioxidbläschen, die sich beim Aushärten im Käse bilden, beim Schneiden des Käses zu Löchern werden. Eine der Bakterienarten, die bei der Züchtung von Schweizer Käse verwendet wird, produziert im Rahmen ihres Stoffwechsels Kohlendioxid.
Das Bakterium Propionibacterium freudenreichii, eine von mehreren Bakterienarten, die bei der Herstellung von Schweizer oder Emmentaler Käse verwendet werden, produziert Kohlendioxid aus der Fermentation von Milchsäure während der Käsereifung. Dieses Bakterium kommt in Schweizer und Emmentaler Käse in grösseren Mengen vor als in anderen Käsesorten, was erklärt, warum Blasen in diesen Käsesorten deutlicher sind als in den meisten anderen Käsesorten.
