Mäuse werden kannibalisch, wenn sie gestresst sind. Dies ist kein normales Verhalten für Mäuse, obwohl mütterlicher Kannibalismus bei Babys viel häufiger vorkommt als andere Formen. Wenn Babys ausgeschlachtet werden, werden sie in der Regel vorher von Erwachsenen getötet. Kannibalismus von toten Erwachsenen tritt unter Bedingungen des Hungers und der Überfüllung auf.
Mäuse gelten als kinderfeindliche Spezies. Das Töten und Essen von Welpen durch die Mutter wird als Abwehrmechanismus angesehen, wie es insbesondere bei Mäusen zu beobachten ist, die für ein starkes Nest-Verteidigungsverhalten gezüchtet wurden. Einige Mäuselinien töten mit größerer Wahrscheinlichkeit Welpen als andere. Kindertötung wird oft mit menschlichem Umgang in Verbindung gebracht, daher werden Mütter manchmal betäubt, um dies zu verhindern.
Kannibalismus unter anderen Bedingungen gilt als ungewöhnlich. Es wurde beobachtet, dass Mäuse kannibalisch werden, um kalte Winter zu überleben, wenn schwindende Nahrungsvorräte die Population der Tiere nicht ernähren können. Zum Beispiel können tote Mäuse, die in Fallen gefangen sind, für Überlebende zu Nahrung werden. Unter normalen Bedingungen essen Mäuse lieber süße und kohlenhydratreiche Nahrung als Fleisch.