Mäuse leben in fast jedem Land der Erde und leben normalerweise in einer Vielzahl von künstlichen Strukturen, darunter Bauernhöfe, Minen, Häuser, Lagerhäuser und Büros. Wilde Mäuse leben in einer Vielzahl von Außenbereichen, darunter Ackerland, Weiden, Küstendünen und -ebenen, Sümpfe und Wälder. Der Wechsel der Jahreszeit kann den Lebensraum beeinträchtigen und dazu führen, dass Outdoor-Mäuse versuchen, in Innenbereiche mit mehr Wärme und Schutz zu ziehen.
Mäuse, die in Innenräumen leben, können an verschiedenen Orten leben, sogar innerhalb einer menschlichen Wohnung. Mäuse graben sich in Wände, Isolierungen, Dachböden, Kriechkeller und sogar Polstermöbel ein. Mäuse sind klein und können in unglaublich kleine Räume passen, in Materialien wie Holz, Gips und beschädigten Ziegeln graben und durch Rohre, Maschen und Kabel kriechen. Sie können sich auch in Maschinen und Fahrzeugen niederlassen. Mäuse leben auch in der Nähe menschlicher Behausungen, insbesondere auf Feldern, Wäldern und landwirtschaftlichen Flächen, auf denen es reichlich Nahrung gibt.
Mäuse sind ursprünglich in Asien beheimatet, aber das Verstauen auf den Schiffen europäischer Siedler führte zu ihrer Einführung in eine Reihe neuer Lebensräume. In Neuseeland, Australien und im Südatlantik gelten Mäuse als invasive Arten, und sie haben Ausmaße erreicht, die den Gemeinschaften und Pflanzen in den Gebieten, in denen sie leben, Schaden zufügen.