Protisten leben in Seen, Flüssen, Ozeanen, Teichen und feuchten Sedimenten. Da es sich um mikroskopisch kleine Organismen handelt, können sie in fast jedem Teil der Welt leben, der Wasserspuren aufweist, um ihr Leben zu unterstützen .
Einige der häufigsten Gruppen von Protisten, die in Flüssen, Seen, Ozeanen und anderen Gewässern zu finden sind, sind:
Flagellaten: Sie sind im Vergleich zu anderen Protisten am kleinsten. Sie bewegen sich durch den Einsatz von Flagellen, die sie dahin bringen, wohin sie wollen.
Ciliaten: Ciliaten bewegen sich durch die Verwendung von feinen haarähnlichen Merkmalen, die normalerweise als Flimmerhärchen bezeichnet werden. Die Flimmerhärchen machen sie zu guten Schwimmern, obwohl sie die größte der verschiedenen Gruppen von Protisten sind.
Sporozoa: Diese Protisten können sich nicht alleine bewegen, da sie keine Bewegungsmerkmale haben. Sporozoen sind im Allgemeinen parasitär und sind daher auf die Bewegung ihrer Wirte angewiesen. Sie klammern sich wahrscheinlich an Tiere wie Schildkröten und Fische.
Heliozoen: Es ist bekannt, dass Heliozoen eher in Süßwasserkörpern wie Seen als in Ozeanen leben. Sie zeichnen sich durch einen Mangel an Skelett und steife amöboide Pseudopodien aus.
Andere Protisten sind Amöben und Radiolarianer.