Es kann schwierig sein, die genaue Anzahl der Lemuren auf der Welt zu bestimmen, da ständig neue Arten entdeckt werden. Die meisten Arten gelten jedoch als gefährdet und vom Aussterben bedroht, und eine Art ist vom Aussterben bedroht.
Lemuren gehören laut einer Überprüfung der International Union for Conservation of Nature Species Survival Commission aus dem Jahr 2012 zu den am stärksten gefährdeten Säugetierarten der Welt. Eine Art, der nördliche Sportmaki, ist so kurz vor dem Aussterben, dass nur 18 Individuen leben noch in freier Wildbahn. Von den 103 bekannten Lemurenarten der Welt sind 93 einer gewissen Bedrohung ausgesetzt. Von diesen 93 bedrohten Arten sind 19 als „gefährdet“, 52 als „gefährdet“ und 23 als „vom Aussterben bedroht“ eingestuft, was bedeutet, dass sie besonders vom Aussterben bedroht sind. Nur drei Arten gelten nicht als gefährdet.
2005 wurden 41 Lemurenarten als "gefährdet", "gefährdet" oder "vom Aussterben bedroht" eingestuft. Der starke Anstieg der Zahlen von 2012 ist auf zwei wichtige Faktoren zurückzuführen: erhöhte Bedrohungsstufen und die Entdeckung mehrerer neuer Lemurenarten.
Die größte Bedrohung für Lemuren ist die Zerstörung von Lebensräumen. Ihr Lebensraum ist auf die Insel Madagaskar beschränkt. Die Regenwälder, in denen sie leben, sind durch illegalen Holzeinschlag, illegalen Bergbau und politische Probleme bedroht. Auch Lemuren werden von Wilderern bedroht.
Obwohl viele Arten großen Bedrohungen ausgesetzt sind, haben sich einige Arten erholt. Zum Beispiel stieg die Population der größeren Bambuslemuren von 100 auf 500 Individuen.