Eine Wasseruhr verwendet fließendes Wasser, um die Zeit gemäß dem National Watch and Clock Museum zu messen. Wasseruhren werden entweder als "Abfluss"- oder "Zufluss"-Wasseruhren klassifiziert, je nachdem, wie Flüssigkeit einströmt Beziehung zum Primärgefäß.
Die Zeit wird mit einer Wasserablaufuhr gemessen, indem ein Gefäß mit Wasser gefüllt und langsam so gleichmäßig wie möglich abgelassen wird. Markierungen im Inneren des Schiffes werden beobachtet, um zu messen, wie viel Zeit vergeht. Laut FactMonster.com ähnelt diese Art von Wasseruhr den Clepsydras, die im antiken Griechenland um 325 v. Chr. verwendet wurden. Griechische Clepsydras waren Steinschalen mit schrägen Seiten, die Wasser mit einer fast konstanten Geschwindigkeit aus einem kleinen Loch in der Nähe des Bodens tropfen ließen.
Eine Zuflussuhr funktioniert umgekehrt wie das Abflussmodell. Diese Art von Wasseruhr verwendet Flüssigkeit, um einen Behälter zu füllen, anstatt ihn abzuleiten. Wenn das Wasser steigt, kann die Zeit anhand der Stunden- und Minutenmarkierungen im Inneren des Schiffes gemessen werden. FactMonster.com berichtet, dass in Teilen Nordafrikas bis heute eine Art Zuflussuhr verwendet wird. Eine Metallschüssel mit einem Loch im Boden wird in ein größeres Gewässer gestellt, und wenn das Wasser langsam in die Schüssel sickert, sinkt es innerhalb einer bestimmten Zeit.
Da es schwierig ist, die Wasserdurchflussrate genau zu kontrollieren, haben beide Arten von Wasseruhren eine unterschiedliche Fehlerquote.