Protisten dienen zahlreichen Zwecken im Ökosystem, einschließlich der Produktion von 70 bis 80 % des weltweiten Sauerstoffs, sind eine Hauptnahrungsquelle für Wassertiere und ein wichtiger Zersetzungsfaktor für totes Material. Protisten können sich messen bis 300 Fuß lang, wie im Fall des riesigen Seetangs der Seetangwälder im Pazifischen Ozean.
Protisten spielen aufgrund ihrer Rolle bei Krankheiten auch eine Rolle im Ökosystem. Einige der Krankheiten, mit denen sie in Verbindung gebracht werden, sind Malaria und Schlafkrankheit. Die Protisten können auch verwendet werden, um Impfstoffe gegen diese Krankheiten herzustellen. Es gibt auch einige einfachere Alltagsanwendungen für Protisten, darunter Suppenverdicker, Filter und Polierprodukte.
