Reptilienherzen, die Amphibienherzen weitgehend ähneln, sind dreikammerig und bieten mit ihren zwei Vorhöfen, von denen einer sauerstoffreiches Blut und einer sauerstoffarmes Blut aus der Lunge empfängt, eine moderate Trennung von sauerstoffreichem und sauerstoffarmem Blut. Der Ventrikel des Reptilienherzens ermöglicht immer noch die Vermischung von sauerstoffreichem und sauerstoffarmem Blut, was bedeutet, dass es nicht so robust oder so effizient ist wie ein Säugetierherz.
Die Bluttrennung erfolgt, weil die Ankunft des Blutes durch die Vorhöfe unabhängig zeitlich gesteuert wird. Wenn Blut durch beide Vorhöfe gleichzeitig eintrifft, kommt es zu einer Vermischung, die jedoch je nach Körpertemperatur und Aktivitätszustand des Tieres mehr oder weniger stark sein kann.
Sobald das Blut den Conus arteriosus erreicht, wird es durch die drei Kanäle des Truncus arteriosus, dem Eingang zum Kreislaufsystem, gezogen und bewegt sich dann durch den Rest des Reptilienkörpers. Der Konus führt zu drei verschiedenen Systemen, dem Lungenstammsystem und dem linken und rechten systemischen Stammsystem.
Säugetierherzen sind auf ständige Aktivität und ein hohes Maß an Bewegung und Anstrengung ausgerichtet, während Reptilienherzen in kurzen Ausbrüchen besser funktionieren und das Tier häufig ausruhen und an der Kontrolle seiner Körpertemperatur arbeiten müssen. Niedrigere Blutsauerstoffwerte machen Reptilien träge und neigen zum Einschlafen.
