Die meisten Eichhörnchen sind im Allgemeinen Landsäugetiere und haben die Fähigkeit, nach Art eines Hundepaddels zu schwimmen. Sie verwenden ihre langen, buschigen Schwänze zum Steuern, ähnlich wie ein Boot ein Ruder verwendet. Normalerweise gehen sie nur ins Wasser, wenn es nötig ist.
Aufgrund der relativ geringen Größe der meisten Eichhörnchen sind sie nicht die größten Distanzschwimmer, und gelegentlich ertrinken sie, wenn sie das Ufer nicht rechtzeitig erreichen. Obwohl die meisten Rassen, wie das rote Eichhörnchen und das östliche Grauhörnchen, schwimmen können, kann das Flughörnchen nicht. Die zusätzlichen Klappen, mit denen Flughörnchen in der Luft gleiten können, hindern sie im Wasser.