Häufige Geflügelkrankheiten sind Vogelgrippe, Geflügelpocken, Cholera, Newcastle-Krankheit und Eiertropfen-Krankheit bei Enten, Gänsen und Hühnern. Andere häufige Geflügelkrankheiten sind Erkältungen und das Swell-Head-Syndrom. Hühner, Puten, Enten, Gänse und andere Geflügelarten können auch mit Botulismus, Enteritis ulcerosa, Enzephalitis, Cholera und Staphylokokken-Infektionen infiziert werden. Aufgrund der hohen Konzentrationen von Geflügelpopulationen in der modernen Geflügelhaltung kann sich die Krankheit schnell ausbreiten.
Geflügel kann auch mit zwei Arten von Leukose infiziert werden, infektiöser Laryngotracheitis, Putenrhinotracheitis, Chlamdyiose und verschiedenen Mykoplasmeninfektionen. Einige andere Krankheiten, die Geflügel betreffen, sind Vogelenzephalomyelitis, Aspergillose und infektiöse Bursitis.
In einem Serviceartikel des University of Florida Institute of Food and Agricultural Sciences Extension werden Geflügelkrankheiten in drei Hauptkategorien unterteilt. Dies sind die 16 viralen und bakteriellen Atemwegserkrankungen, acht nicht-respiratorische virale Erkrankungen und sieben nicht-respiratorische bakterielle Erkrankungen. Einige dieser Krankheiten haben Unterarten, und manche betreffen nur bestimmte Geflügelarten. Der Putengeier zum Beispiel ist die einzige Art, die nicht durch Botulismus infiziert wird. Auf der anderen Seite betreffen die beiden Arten von Bronchitis nur Hühner und weiße Wachteln.
Die IFAS-Erweiterungsseite der University of Florida enthält klinische Anzeichen der Krankheiten, Behandlungsmöglichkeiten, falls verfügbar, und Präventionsmaßnahmen. Die Seite listet auch auf, welche Krankheiten welche Geflügelart befallen können.
Es wird am häufigsten bei Hühnern und Puten gefunden und seltener bei Enten, Gänsen, Tauben, Kanarienvögeln und anderen Wild- oder Haustiervögeln. Aspergillose kann akute und chronische Infektionen verursachen und tritt normalerweise bei Vögeln auf, die 7 bis 40 Tage alt sind. Es wird angenommen, dass es durch eine beeinträchtigte Immunität und das Einatmen einer großen Anzahl von kontaminierten Sporen verursacht wird.
Die Vogelgrippe oder Vogelgrippe wird durch die Sekrete infizierter Vögel verbreitet und durch das H5N1-Virus verursacht. Mücken und Zecken können auch die Vogelgrippe übertragen, wobei die Ausbrüche oft mit der Regenzeit zusammenfallen, in der es reichlich Moskitos gibt. Die Vogelgrippe ist auf Menschen übertragbar, und seit 2004 sind alle bekannten Fälle in Südostasien aufgetreten, die von Menschen betroffen sind, die mit Hühnern umgehen. Infizierte Vögel scheiden das Virus über ihren Speichel, Kot und Nasensekret aus. Seit 2015 stufen die Centers for Disease Control das Risiko einer Übertragung auf Menschen als gering ein.
Botulismus tritt bei Geflügel durch die Aufnahme des Toxins Clostridium botulinum auf, ein im Boden weit verbreitetes Bakterium. Die sich zersetzende Vegetation in Verbindung mit warmen Temperaturen bietet eine ideale Umgebung für das Auftreten von Botulismus. Botulismus führt häufig zum Tod bei Wasservögeln, wobei Enten am häufigsten betroffen sind.