Da sie keine separaten Öffnungen für Fortpflanzung und Ausscheidung haben, wird die hintere Darmöffnung in den Ausscheidungssystemen von Haien eher Kloake als Anus genannt. Im Verdauungssystem von Haien passiert die Nahrung einen einzigen kurzen Darm und wird anschließend durch die Kloake ausgeschieden.
Bei Haien passiert die Nahrung zuerst die Speiseröhre, wo fingerartige Verlängerungen das Entweichen der Nahrung verhindern. Die Mägen von Haien sind J-förmig und haben etwa 20 Prozent ihrer Länge. Die muskulären Magenwände haben Zellen, die Salzsäure produzieren, die Knochen erweicht und auflöst, und Schleim, um die Magenschleimhaut zu schützen. Muskelringe an den Magenwänden führen eine Peristaltik durch, um die Nahrung zu mischen und zu zersetzen. Der Darm ist der Ort der Nährstoffaufnahme. Beim Menschen misst der kombinierte Kurz- und Langdarm etwa 28 Fuß lang, während der Darm eines Hais nur einen Fuß lang, aber viel breiter ist. Der Darm eines Hais arbeitet sehr langsam, um Nahrung zu verdauen. Menschen können Nahrung nur 4 Stunden nach dem Essen entziehen, aber bei Haien kann der Vorgang 16 bis 17 Stunden dauern.
Eine andere Methode, die ein Hai verwendet, um Abfälle zu entleeren, besteht darin, seinen Magen umzudrehen. Wenn es unverdauliche Stoffe im Magen hat, stößt es seinen Magen von innen nach außen durch den Mund aus, spült den Magen mit Meerwasser aus und zieht ihn in seine normale Position zurück.