Zu den Nagetieren, die sich graben, gehören Streifenhörnchen, Erdhörnchen, Känguru-Ratten und Wühlmäuse. Präriehunde und Waldmurmeltiere sind größere Nagetiere, die Löcher mit einem Durchmesser von 3 bis 20 Zoll erzeugen. Waldmurmeltierhöhlen sind in der Regel größer und enthalten sowohl Vorder- als auch Hintertürlöcher. Präriehundelöcher produzieren an den Rändern hochgedrückte Erde.
Die Löcher von Streifenhörnchen, Ratten, Wühlmäusen und Erdhörnchen sind mit einem Durchmesser von weniger als 3 Zoll kleiner als die der größeren Nagetiere. Sowohl Erdhörnchen- als auch Streifenhörnchenlöcher sind klein und sauber, und Känguru-Rattenlöcher sind länger als hoch. Diese Löcher werden auch in sandigem Boden gegraben. Einige der kleinsten Löcher und Höhlen sind die von Wühlmäusen mit einem Durchmesser von nur einem Cent. Wühlmäuse neigen dazu, ihre Höhlen um Pflanzen herum zu graben.
Einige andere grabende Nagetiere sind Pacas, Tuco-Tucos, Gophers und Maulwurfsratten, von denen die ersten beiden in Südamerika beheimatet sind. Der Paca oder gefleckte Meerschweinchen hat ein geflecktes bräunliches Fell, während der Tuco-Tuco eher einer Ratte ähnelt.
Grabende Nagetiere haben sich an das Graben mit starken Nägeln angepasst, eine Praxis, die dem Boden sowohl nützen als auch schaden kann. Präriehunde belüften beispielsweise den Boden, in dem sie leben, aber dies kann auch für Nutztiere, die in die Löcher treten, Probleme bereiten.