Die Hauptursachen für die Wasserverschmutzung in Afrika sind: Urbanisierung, Entwaldung, industrielle Prozesse, Bergbau und Landwirtschaft. Wasserverschmutzung kann als Verschmutzung von Gewässern wie Ozeanen, Seen, Grundwasserleitern und Flüssen beschrieben werden. Sie tritt auf, wenn Schadstoffe in Gewässer eingeleitet werden, ohne schädliche Verbindungen zu entfernen oder zu behandeln.
Da immer mehr Menschen in die Städte Afrikas ziehen, tragen sie zu einer Reihe von Faktoren bei, die zur Wasserverschmutzung führen. Urbanisierung führt zu Staus in städtischen Gebieten, was zu einer unzureichenden Abwasserbewirtschaftung und -behandlung führt. Wenn unbehandeltes Abwasser aus diesen überlasteten städtischen Gebieten in Gewässer eingeleitet wird, führt dies zu Wasserverschmutzung. Auch Chemikalien aus der Industrie in städtischen Gebieten verursachen Wasserverschmutzung.
Die Rodung von Land für Stadtwachstum und Landwirtschaft führt zu Wasserverschmutzung. Wenn der Boden ohne Abdeckung bleibt, wird er anfällig für Bodenerosion. Der Boden wird bei Regen in Gewässer gespült, wodurch das Wasser schmutzig und für den menschlichen Gebrauch unbrauchbar wird.
Viele Entwicklungsländer in Afrika erleben ein schnelles industrielles Wachstum ohne geeignete Abfallentsorgungsmaßnahmen. Industrien produzieren Abfall, der den pH-Wert des Wassers verändert, seine Farbe ändert und zur Eutrophierung führt, einem Prozess, bei dem überschüssige Nährstoffe ein übermäßiges Pflanzenwachstum verursachen, was wiederum zu weiterer Verschmutzung führt.
In vielen afrikanischen Ländern, wie Nigeria und Südafrika, gibt es viele Bergbauaktivitäten, die die Menge der in Gewässern abgelagerten Salze und Mineralien erhöhen und den pH-Wert des Wassers beeinflussen.
Die meisten afrikanischen Volkswirtschaften sind von der Landwirtschaft abhängig. Einige Methoden in der Landwirtschaft erhöhen die Bodenerosion und verwenden überschüssige Düngemittel und Pestizide. Wenn es regnet, werden die lockere Erde, überschüssige Düngemittel und Pestizide in die Gewässer gespült und verursachen Wasserverschmutzung.