Die Nahrungskette eines Korallenriffs beginnt mit Algen, die Nahrung aus Wasser, Kohlendioxid und Sonnenlicht produzieren, die von mikroskopisch kleinen Organismen, Wirbellosen, Fischen und Schildkröten gefressen werden, die wiederum von Raubtieren gefressen werden. Alle Ökosysteme, einschließlich Korallenriff-Ökosysteme, haben Produzenten, Verbraucher und Zersetzer.
Korallenriffe werden von Korallen, wirbellosen Tieren geschaffen, die mit Seeanemonen und Quallen verwandt sind, die in großen Kolonien leben und harte Skelette aus Kalziumkarbonat absondern. Korallen können keine eigene Nahrung produzieren, aber viele sind Wirte für verschiedene Algenarten in ihrem Gewebe, das sie schützen, und erhalten im Gegenzug Energie von ihnen. Einige Korallen fressen kleine Fische oder Wirbellose, die vorbeischwimmen. Andere Algen leben außerhalb der Korallen, als frei schwebende Einzelzellen oder als Algen.
Korallen und Algen werden von verschiedenen Fischarten und anderen Tieren gefressen. Falterfische, Feilenfische und Riffbarsche sind spezialisierte Korallenfresser, obwohl verschiedene Arten unterschiedliche Teile der Korallen fressen. Am Ende der Nahrungskette stehen die Zersetzer und Detritivoren, die tote Organismen abbauen. Im Korallenriff sind dies vor allem Bakterien. Aber auch Tierarten tragen zum Nährstoff-Recycling bei, das die Bakterien durchführen, darunter Seegurken, Schnecken, Krabben und Borstenwürmer.