Zu den Produkten der aeroben Zellatmung gehören Wasser, Kohlendioxid, Adenosintriphosphat (ATP) und zwei verschiedene energietransportierende Moleküle: NADH und FADH2. Der Prozess soll letztendlich ATP produzieren – ein Molekül, das enthält die Energie, die für die verschiedenen Funktionen der Zelle verwendet wird.
Wasser entsteht, wenn Glukosemoleküle während der Glykolyse abgebaut werden. Das überschüssige Wasser verlässt den Körper durch Atmung, Schwitzen und Wasserlassen. Kohlenstoffmoleküle werden in verschiedenen Phasen des Prozesses abgegeben und verlassen den Körper als Kohlendioxid durch die Atmung. ATP ist das Endprodukt der Atmung, das Energie an die Zelle abgibt, wenn die Phosphatbindungen im Molekül aufgebrochen werden. NADH und FADH2 halten auch Energie in ihren Wasserstoffbrückenbindungen und es entsteht mehr ATP, wenn diese Bindungen gespalten werden.