Laut dem Wissenschaftsjournal Nature werden die Unterschiede zwischen Pseudohyphen und Hyphen durch die Form der Zellen, die Lage des Septinrings und des Septums relativ zur Mutterzelle und die Verlagerung des Zellkerns von der Mutterzelle. Der Grad des polarisierten Wachstums und der Grad, in dem sich die Tochterzellen in einzelne Zellen aufspalten können, unterscheiden ebenfalls zwischen Pseudohyphen und Hyphen.
Hyphen, die Pluralform von Hyphen, gelten als die Bausteine der meisten Pilze. Sie bilden zum Beispiel den Körper eines Pilzes. Sie bestehen aus filamentösen röhrenförmigen Wänden, die winzigen Fäden ähneln, die durch Septen oder Septum, die Querwände der Zelle, in einzelne Zellen unterteilt sind. Einzelne Hyphenzellen sind lang, dünn und stark polarisiert ohne offensichtliche Überlappungen oder Einschnürungen zwischen den Zellen. Pseudohyphen hingegen ähneln verlängerten Ellipsoiden. Die ellipsoidförmigen Zellen bleiben während ihres Wachstums an der verengten Trennstelle miteinander verbunden. Als Ergebnis beginnen die Pseudohyphen zu einem Verzweigungsmuster zu wachsen. Die Nature-Website erklärt, dass die Platzierung des Zellkerns während des Zellwachstums zusammen mit dem Grad der Zelltrennung zwischen den neuen Tochterzellen auch Hyphen von Pseudohyphen unterscheidet.
