Krill wird von Walen, Pinguinen, Robben, Tintenfischen, Fischen und Menschen gefressen. Obwohl Krill auch von Hunderten anderer Tiere gefressen wird, sind dies ihre größten Feinde. Wale fressen die größte Menge Krill; Der Blauwal kann täglich bis zu vier Tonnen Krill fressen. Die Nahrung der Adelie-Pinguine besteht hauptsächlich aus Krill, obwohl alle 17 Pinguinarten auf Krill angewiesen sind, um zu überleben.
Kleinere Robbenarten sind zum Überleben auf Krill angewiesen, während größere Robben wie die Leopardenrobbe hauptsächlich andere Tiere wie Pinguine und jüngere Robben fressen. Die meisten Krill werden in der Arktis gefangen, aber ihre Zahl ist seit den 1970er Jahren um mindestens 80 Prozent zurückgegangen. Aus diesem Grund wird die Krillfischerei jetzt überwacht, um die schwindende Bevölkerung zu schützen.
Der Rückgang des Krills wird durch Störungen in ihrem Ökosystem wie die globale Erwärmung und den Klimawandel verursacht. Steigende arktische Temperaturen aufgrund der globalen Erwärmung haben dazu geführt, dass sich weniger Meereis gebildet hat, was zu weniger Nahrung für den Krill führt, da er die Algen fressen, die unter dem Meereis wachsen. Eine weitere Ursache für den Rückgang der Krillpopulation war ein Rückgang der Kieselalgenkonzentration im Beringmeer, der 1998 während einer Coccolithophorenblüte auftrat. Coccolithophoren sind auch Teil der Nahrung des Krills, und der Konzentrationsabfall führte dazu, dass sie kleiner wurden. Kill können sich nicht von dem kleineren Coccolithophor ernähren, was dazu führt, dass der Krill weniger Nahrung zur Verfügung hat.