Ohne modernes medizinisches Wissen gab es viele Vermutungen über die Ursache der Pest, von der göttlichen Bestrafung bis hin zur Vergiftung der Brunnen durch Juden. Während der Pest gab es viele Verfolgungen und Todesfälle, die aus voreingenommenen Überzeugungen resultierten. Menschen mit etwas so Alltäglichem und Grundlegendem wie Akne wurden oft getötet, aus Angst, dass sie die Quelle der Pest waren oder sie verbreiteten.
Die Europäer waren so verzweifelt, die Pest zu vermeiden, dass viele Menschen ihr gesamtes Hab und Gut der Kirche schenkten, in der Hoffnung, Vergebung zu erkaufen und sich von der Krankheit zu erholen. Das hat natürlich niemanden vor der Pest bewahrt und die Kirche am Ende sehr reich gemacht.
Es gab Extreme sowohl bei der religiösen Reue der Menschen als auch bei den Versuchen, sich durch die Kirche zu retten, und bei denen, die sich von der Kirche abwandten und zu unzüchtigeren Taten führten. Flagellanten gingen von Stadt zu Stadt, wo sie sich für eine bestimmte Zeit selbst auspeitschten und dann in eine andere Stadt weiterzogen. Dies war ein Versuch dieser Leute, sich selbst zu reinigen und dabei zu helfen, die Städte, die sie besuchten, zu reinigen. Sie taten dies nicht, ohne auch etwas für sich selbst zu tun. Damit sie ihre Dienste leisten konnten, mussten die Hilfesuchenden eine Gebühr zahlen.