Sonnenflecken sind dunkel, weil sie laut Cool Cosmos, einem Gemeinschaftsprojekt des Jet Propulsion Laboratory der National Aeronautic and Space Administration und des Infrared Processing and Analyses Center des California Institute of Technology, viel kühler sind als die umgebenden Teile der Sonne . Diese Sonnenflecken haben normalerweise Temperaturen von ungefähr 6.300 Grad Fahrenheit, während die umgebenden Teile der Sonne ungefähr 10.000 Grad Fahrenheit haben.
Wie auf SpaceWeather.com erklärt, zählen und katalogisieren Wissenschaftler diese coolen Spots von Planetengröße. Nach Angaben des Marshall Space Flight Center variiert die Häufigkeit der Sonnenflecken mit der Zeit. Im späten 17. und frühen 18. Jahrhundert war die Sonnenfleckenaktivität sehr gering. Gleichzeitig mit dieser Verringerung der Sonnenfleckenfrequenz sank die Temperatur der Erde erheblich. Diese Zeit wird oft als „kleine Eiszeit“ bezeichnet, da viele Flüsse und Schneefelder länger als normal gefroren blieben. Es gibt einige Hinweise darauf, dass ähnliche kühle Perioden auch in der ferneren Vergangenheit aufgetreten sind.
Laut Windows to the Universe der National Earth Science Teachers Association verursacht das Magnetfeld der Sonne die Sonnenflecken. Einmal gebildet, können die Sonnenflecken nur wenige Stunden oder mehrere Monate dauern. Sonnenflecken schwanken typischerweise in einem 11-Jahres-Zyklus. Auch wenn Sonnenflecken auf der Sonnenoberfläche dunkel erscheinen, sind die Bereiche immer noch fast so hell wie der Vollmond, und wenn sie von der Sonne wegbewegt würden, wären sie leuchtend.