Translokationsmutationen treten auf, wenn ein Teil eines Chromosoms verlagert wird. Die Gene von einem Chromosom können an eine andere Position auf demselben Chromosom wandern; alternativ können sie in ein anderes Chromosom eingebaut werden.
In einigen Fällen, die als reziproke Translokationen bezeichnet werden, werden Segmente zweier Chromosomen miteinander vertauscht. Wenn dies geschieht, haben beide beteiligten Chromosomen im Wesentlichen die gleiche Menge an genetischer Information vor und nach der Mutation. In anderen Fällen werden Gene von einem Chromosom entfernt und ohne entsprechenden Ersatz in ein anderes Chromosom eingefügt. Diese Fälle werden unidirektionale Translokationen genannt und führen zu zwei Chromosomen mit merklichen Unterschieden in ihrer Genanzahl nach der Mutation.
Translokationen sind nicht die einzige Art von Chromosomenmutation. Andere Arten von Chromosomenmutationen sind Inversionen, Duplikationen und Mängel.