Kapuzineraffen sind normalerweise keine guten Haustiere. Trotz ihrer sozialen Natur und ihrer hohen Intelligenz stellen Kapuzineraffen Haustierbesitzer viele einzigartige Probleme. Ein solches Hindernis ist das Fehlen eines natürlichen Lebensraums für eine Affenart, die es vorzieht, von Bäumen zu schwingen.
Diese in Mittel- und Südamerika beheimateten Affen können Krankheiten wie Hepatitis auf ihre Besitzer übertragen. Die kleinen Tiere, die bis zu 4 Kilo werden, erkranken auch beim Menschen. Viele Kapuzineraffen als Haustiere werden aufgrund der angepassten Ernährung, die sie konsumieren, zuckerkrank. Sie müssen aus hygienischen Gründen Windeln tragen, und die Kosten sind angesichts der Lebensdauer des Tieres von bis zu 40 Jahren erheblich. Die Affen beißen gelegentlich und die Ergebnisse sind manchmal ernst.