Die North Dakota State University definiert eine DNA-Sonde als ein kleines Stück Nukleinsäure (normalerweise einzelsträngige DNA), das zum Nachweis komplementärer DNA-Abschnitte verwendet wird. DNA-Sonden, die in Hybridisierungsexperimenten verwendet werden, sind markiert damit sie visualisiert werden können.
Wie Wikipedia erklärt, werden DNA-Sonden normalerweise mit radioaktiven oder fluoreszierenden Basen markiert. Es ist üblicher, fluoreszierende DNA-Sonden zu verwenden, da eine Vielzahl verschiedener Fluoreszenzwellenlängen ausgewählt werden kann, wodurch Wissenschaftler mehr als eine Sonde gleichzeitig mit einer bestimmten Probe hybridisieren können.
Laut "Human Molecular Genetics" können DNA-Sonden für eine Vielzahl unterschiedlicher molekularbiologischer Techniken verwendet werden. Bei Verwendung mit einem Southern- oder Northern-Blot können DNA-Sonden verwendet werden, um Größenfragmente eines Gens oder eines anderen fraglichen DNA-Segments nachzuweisen.
DNA-Sonden können auch für Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierungstechniken verwendet werden, bei denen Chromosomen auf Objektträgern denaturiert werden. Dieses Verfahren ermöglicht den Nachweis größerer Chromosomenaberrationen, einschließlich gebrochener oder verschmolzener Chromosomen. Chromosomen-Maltechniken verwenden In-situ-Hybridisierung, um Metaphase-Chromosomen in verschiedenen Farben zu malen, was die Chromosomenkartierung erleichtert. Diese Technik kann auch verwendet werden, um Chromosomensequenzen nachzuweisen, die zwischen verschiedenen Spezies konserviert wurden.