Kleopatra wurde nach dem Tod ihres Vaters Pharao. In seinem Testament überließ Ptolemaios XII. die Monarchie der 17-jährigen Kleopatra und ihrem 10-jährigen Bruder Ptolemaios XIII zusammen.
Kleopatra hatte Ptolemaios XIII geheiratet, als sie 12 Jahre alt war, weil sie ohne einen männlichen Miterben nicht regieren konnte. Die ptolemäische Tradition besagte, dass der männliche Herrscher der Oberste sei und verlangte, dass sein Name an erster Stelle steht. Drei Jahre nach der gemeinsamen Thronbesteigung bestand Kleopatra jedoch darauf, dass nur ihr Name auf allen offiziellen Dokumenten und nur ihr Bild auf Münzen gedruckt werden sollte.
Ptolemaios XIII rächte sich, indem er Kleopatra ins Exil schickte. Ptolemäus regierte im Alter von 13 Jahren allein und suchte die Unterstützung Roms, indem er Pompeius, einen von Caesars politischen Feinden, hinrichtete. Da Pompeius mit Caesars Tochter verheiratet war, war Caesar über den Mord empört und marschierte in die Hauptstadt Ägyptens ein, wodurch er zu einem Vermittler zwischen den konkurrierenden Interessen von Ptolemaios und Kleopatra wurde.
Kleopatra nutzte Caesars Wut auf Ptolemaios und ließ sich in einen Teppich einrollen und schmuggelte sich hinein, um Caesar zu treffen. Sie wurde seine Geliebte und gebar seinen Sohn, und Caesar half ihr, den Thron zurückzugewinnen, indem er Ptolemaios Armee besiegte; Ptolemaios ertrank im Nil und sie heiratete den nächsten Bruder in der Reihe, Ptolemaios XIV., wie es Brauch war.
Nach Caesars Ermordung wurde Kleopatra zur Geliebten von Mark Anton. Als Ägypten unter römische Herrschaft fiel, begingen beide Selbstmord.