Weißkopfseeadler vermehren sich durch sexuelle Fortpflanzung, sobald sie das Alter der Geschlechtsreife erreicht haben, normalerweise im Alter von etwa vier oder fünf Jahren. Im Gegensatz zu vielen anderen Tieren paaren sich Weißkopfseeadler lebenslang, es sei denn, einer der Vögel stirbt laut BaldEagleInfo.com.
Sobald ein Weißkopfseeadler geschlechtsreif ist, beginnt er, nach einem Partner zu suchen. Wenn zwei Vögel Partner werden, bauen und schützen beide das Nest. Ein Adlernest oder ein Horst kann je nach Standort verschiedene Formen haben, einschließlich zylindrischer, konischer, scheibenförmiger und schalenförmiger Nester. Diese Nester werden oft entlang von Flüssen oder Küsten an hohen Stellen wie Bäumen oder Klippen gebaut.
Sobald der Horst gebaut ist, paaren sich die Weißkopfseeadler. Während der Paarungszeit sieht man Adler oft mit zusammengeschlossenen Krallen durch die Luft wirbeln. Experten sind sich nicht sicher, ob es sich um ein Balzritual oder einen ritualisierten Kampf zwischen einem Revieradler und einem Eindringling handelt. Es wird oft mit der Reproduktion von Weißkopfseeadlern verwechselt, ist es aber nicht.
Die Fortpflanzung des Weißkopfseeadlers findet auf einem Ast in der Nähe des Nestes oder auf dem Boden statt. Weißkopfseeadler können bis zu 30 Jahre alt werden, sodass sie sich nicht ständig vermehren müssen.
Das Weibchen legt fünf bis zehn Tage nach der Kopulation ein bis drei Eier. Diese Eier werden an verschiedenen Tagen gelegt, nicht alle auf einmal. Von dort aus haben die Eier eine 35-tägige Inkubationszeit, in der die Verantwortung zwischen Männchen und Weibchen aufgeteilt wird. Die Eier schlüpfen dann in der Reihenfolge, in der sie gelegt wurden.